Lenguajes de programación para la bioinformática
Palabras clave:
lenguaje de programación, bioinformática, digitalResumen
Hoy en día, con el avance de la informática, las redes de comunicación y las nuevas técnicas de laboratorio, podemos disponer de gran cantidad de información en formato digital. En el caso de la biología, hay multitud de bases de datos que almacenan información procedente de experimentos biológicos y se están realizando experimentos con aparatos que nos pueden devolver una gran cantidad de información en !cheros informáticos, como por ejemplo los secuenciadores de nueva generación y los experimentos con micromatrices.
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Falgueras J., et al. SeqTrim: a high-throughput pipeline for preprocessing any type of sequence reads BMC Bioinformatics 2010, 11:38
Goto et al. BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language. Bioinformatics 2010, 26(20):2617-9
Cock et al. Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics. Bioinformatics. 2009, 25(11):1422-3
Fourment M. and Gillings M.R. A comparison of common programming languages used in bioinformatics. BMC Bioinformatics 2008, 9:82
Stajich JE. An introduction to BioPerl. Meth Mol Biol 2007, 406:535-48
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