La no distinción de diferentes lenguajes, el bioinformático, el gramatical, el atmósférico-ambiental genera un impacto sin sentido aparente, aunque sí aparece una evidente correspondencia entre diferentes carácteres que podría ser sujeto de un análisis posterior. No nos interesa en este ensayo abordar este análisis sino evidenciar el choque de naturalezas.
Presentación
Para la activación textual partimos de tres elementos de naturalezas diferentes:
1. Primeramente y de manera principal nos basamos en un proceso que la bioinformática ha denominado “Alineamiento de secuencias” y es una forma de representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN para resaltar sus zonas de similitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o proteínas consultados.
Los dos siguientes elementos de la activación son los que utilizaremos como elementos para ser procesados por el “Alineamiento de secuencias”:
2. Utilizaremos 10 aforismos del divulgador científico y “pensador de preguntas” Jorge Wagensberg de su libro del año 2002 “Si la naturaleza es la respuesta, ¿cuál era la pregunta?”.
3. El segundo elemento a procesar-comparar es el resultado textual de los pronósticos climatológicos de los 7 últimos días de octubre del año 2023, que coinciden con los días en los que se redactó este ensayo. Estos textos se obtuvieron del sitio web https://weather.com.
Comparar, confrontar, relacionar, enfrentar siempre son verbos que necesitan de una multiplicidad para que tengan sentido. Aunque también podríamos observar la comparación de un elemento con sigo mismo, pero, por lo general, necesitamos de una mínima multiplicidad. Lo que aquí nos concierne en su estudio es el carácter de la comparación y sus correspondientes sinónimos. Nos interesa comparar naturalezas distintas, aparentemente contradictorias, con el objetivo de generar nuevos horizontes, de la misma manera en que el collage supo encontrar su momento y su contexto para generar nuevas vías comunicativas.
Afor-pronos utiliza como materia prima el texto, pero podríamos decir, que más bien nos interesa los caracteres, las letras de esos textos, ya que con la función de ser comparados se les desnuda de todo significado, solo nos interesa el significante.
Serán pues estos textos sin significado los que serán usados para generar otros nuevos, serán filtrados por un analizador de caracteres, una revisión que busca similitudes para destacarlos. Para ello, entra en acción el “Alineamiento de secuencias”, un programa informático creado para comparar las largas codificaciones de las cadenas de ADN.
El resultado visual varía según el programa de alineamiento usado, así pues, en este ensayo veremos dos maneras de visualizar las comparaciones.
Seguidamente se muestran 7 resultados de las comparaciones a partir de los tres elementos anteriormente descritos.
1_Afor-pronos: probabilidad-sábado
2_Afor-pronos: posible-domingo
3_Afor-pronos: seres-lunes
4_Afor-pronos: manual-martes
5_Afor-pronos: compresión-miércoles
6_Afor-pronos: semilla-jueves
7_Afor-pronos: clasificar-comprimir
Reflexiones externas
El ADN, poema infinito de la vida, secuencia de la narración ancestral de la evolución, se desenreda a lo largo del tiempo como las páginas de un libro antiguo. La literatura, espejo del tiempo, también teje historias que perduran en la memoria colectiva.
Mientras tanto, el clima, un capítulo siempre cambiante, configura el entorno donde estas historias se desenvuelven, influyendo en el destino de cada ser en este vasto relato cósmico. En esta obra las historias se entrelazan incorporando el azar, y el conjunto vincula pasado, presente y futuro, tejiendo una posible trama visual de la existencia.
(Aportación de: Dra. Pilar Rosado Rodrigo)
Comparar, contrastar lenguajes, sistemas de codificación: cada sistema coagula, comprime, una serie de presupuestos, de premisas, axiomas, implícitas y conocidas por los hablantes o usuarios de tal o cual lenguaje. Pero a menudo tendemos a confundir el lenguaje con las cosas a las que refiere, la partitura no es necesariamente los sonidos que prescribe, que propone. El lector, el oyente, construye el mensaje según sus propias capacidades
Según Chomsky tenemos la capacidad innata para el lenguaje. Aza Raskin y el Center for Humane Technology están decodificando los lenguajes animales con IA. Por ahora han descubierto que todos los lenguajes humanos tienen una misma estructura topológica cuando se mapean las relaciones semánticas. David Lynch lee la previsión meteorológica. Entender las relaciones de datos como lenguajes y prever posibles futuros, estadísticamente (comparar frases de Wagensberg, secuencias de ADN, previsión meteorológica, o lo que se quiera). Eso hace Chat GPT, y estamos adoptando este sistema que no comprende si no que computa probabilidades. ¿Qué pensará David Lynch?
Los humanos somos expertos en encontrar patrones en cualquier circunstancia informativa, encontrar relaciones significativas, incluso donde no las hay. La pareidolia -ver caras en cualquier sitio donde parezca haber dos ojos (^ _*) -, ha sido útil en nuestra evolución, reconocer algo familiar en aquello que no conocemos. Los memes auditivos que corren por internet, Yanni o Laurel. Forzar la comparativa y no olvidarnos que los lenguages tienen limitaciones, y que a menudo leeremos aquello que queremos leer.
(Aportación de: Dr. Martí Ruiz i Carulla)
Aclaraciones internas
Este ensayo visual recrea el gran paradigma científico de la codificación bioinformática que nos permite entender quienes somos. De manera concisa este proyecto ha utilizado un software que compara “secuencias proteicas”. Partiendo de que las proteínas y los aminoácidos son los pilares fundamentales de la vida, nos basamos en su codificación para generar una nueva interpretación que suplanta las bases nitrogenadas (ADN-ARN) por palabras gramaticales, de nuestro lenguaje común. Se suplanta un código por otro, el que proviene de la codificación bioinformática por el nuestro más común, nuestro lenguaje escrito, alfabético. Esta suplantación quiere identificar los 22 caracteres que identifican a los aminoácidos con los 26 del alfabeto del lenguaje español. Para poder completar la correspondencia en la que se diferencian por 4 caracteres y llegar a los 26 del alfabeto español, éstos se crean por la combinación entre algunos de ellos, por ejemplo: el carácter B, que no tiene una correspondencia directa con un aminoácido, surge de la combinación de dos ellos, Asparagina o Ácido aspártico ASX.
Para la alineación hemos usado una versión modificada del software Swat5, que nos fue proporcionado por el biólogo e informático Santiago González (durante su participación en el equipo de genómica computacional del BSC, liderado por D. Torrents) a partir de una investigación realizada por el proyecto Geburte que llevé a cabo junto con el artista y docente Aleix Molet en el año 2012, en un contexto mayor del proyecto I+D Metamétodos, financiado por el Ministerio de Ciencia e Innovación. Swat5 sí que incorpora la correspondencia entre 26 símbolos de los aminoácidos y 26 caracteres gramaticales, con la salvedad de todos los signos de acentuación, puntuación, diferenciación entre mayúsculas y minúsculas, etc…, estos quedarán obviados.
El ensayo visual consta de un total de siete comparaciones, seis de ellas entre seis aforismos de J. Wagensberg y 6 pronósticos climáticos y una comparación final entre dos aforismos de este mismo autor. Por otro lado, las cuatro primeras comparaciones y la sexta son el resultado obtenido a través de la modificación del software Swat5 y la quinta y la séptima es una modificación del resultado obtenido a través de la herramienta de alineación de secuencias de proteínas de la compañía Vector Builder a través de su aplicación on-line. La diferencia entre estas dos tipologías de comparaciones es claramente diferenciada, ya que usan formalizaciones propias. Los resultados obtenidos a través de Swat5 han sido objeto de una recodificación cromática, cada carácter tiene asignado un color que viene derivado del propio proceso de obtención de la secuencia mediante la electroforesis capilar y el análisis automatizado. El uso del láser de argón, que excita a los fragmentos de ADN a distintas longitudes de onda, generan respuestas que son identificadas por su tendencia cromática.
Durante el uso de las métodos bioinformáticos se ha pretendido respetar los resultados de manera íntegra a pesar de que, en algunas ocasiones, por cuestiones formales nos hemos permitido obvias licencias que responderían a criterios subjetivos, si es que en algún momento, lo que entendemos como “criterio subjetivo” fuera lo absolutamente opuesto a lo que llamamos “criterio objetivo”.
Referencias / References
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